המרכז לבריאות הנפש באר-שבע הינו אחד מתוך שמונה מרכזים לבריאות הנפש בבעלות משרד הבריאות. המרכז הוקם בשנת 1978 והמנהל הראשון היה פרופ' אלכסנדר פאליק.

המרכז מספק, שירותי אשפוז בריאות נפש לכלל אוכלוסיית הנגב, המונה כ- 850,000 נפש, מאזור אשקלון ועד אילת ומספק שירותים מרפאתיים על פי חלוקה עם נותני שירות נוספים.

המרכז מסונף לאוניברסיטת בן גוריון בנגב, פרוס על פני שטח של למעלה מ- 100 דונם והוא מונה כ-400 מיטות אשפוז פסיכיאטרי ואשפוז יום. כמו כן, במסגרת המרכז פועל הוסטל שיקומי, "בית רותם" המשכן 32 דיירים.

מחלקות ושירותי המרכז פועלים במודל ביו-פסיכו-סוציאלי, מודל זה משלב גישות ביולוגיות פסיכולוגיות וסוציאליות בטיפול בפרט ובמשפחה. כל זאת בכל טווח הגילאים ובכול רמות החומרה, מבעיות בכרוכות באירועי חיים ועד למחלות נפש או אורגניות נפשיות קשות.

במסגרת המרכז פועלים שירותים קהילתיים בבאר-שבע וביישובי הסביבה, בין היתר: מרפאה לילדים ונוער, מרפאת טל, הממוקמת בקהילה, יחידה לטיפול וליווי משפחות המטופלים (מית"ל), מכון לאבחון ושיקום הילד לטיפול בבעיות התפתחות הכולל גן ילדים, מחלקת אשפוז ארצית לטיפול בתחלואה כפולה (התמכרויות יחד עם מחלות נפש), מרפאת "מטרה", שהינה שירות מרפאתי למכורים לחומרים פסיכואקטיביים (סמים) וניידת לחלוקת תחליפי סם, במרחבי הדרום.

המרכז מספק שירותי יעוץ למרפאות ראשוניות, לשירותי הרווחה, לשירותי המבחן, למוסד לביטוח הלאומי, למשרד הביטחון, למרפאות מקצועיות, לתחנות פסיכולוגיות חינוכיות ולגופים נוספים. כן מבצע פעילות הדרכתית, הוראתית ומחקרית מתקדמת. בנוסף, פועלות בו מעבדות מגוונות והוא מקיים שיתופי פעולה עם גופים אקדמיים המובילים בארץ ובעולם.

הנהלת המרכז ועובדיו המסורים פועלים, ללא לאות, ליצירת סביבה טיפולית נגישה, איכותית ומתקדמת וכן ליצירת חווית אשפוז חיובית למטופל ולבני משפחתו. זאת ועוד, במסגרת השאיפה לנורמליזציה ועל מנת לסייע למטופל בהחלמתו ובשיקומו, מטפח המרכז קשר הדוק עם הקהילה.
מספרן של הפניות למרכז עולה באופן עקבי ובשנה האחרונה עמד על קרוב ל 60.000 פניות (לחדר מיון ומרפאות).